在船舶混合动力系统动力切换过程中，若切换控制不当，可能对减排效果产生不利影响。当从主发动机动力切换到电力驱动（如电池供电）时，若过渡时间过长，可能出现动力中断或波动，导致船舶航行状态不稳定，主机在调整过程中可能出现燃油燃烧不充分，使一氧化碳（CO）、碳氢化合物（HC）和颗粒物（PM）排放增加。一般来说，不合理的切换可能使这些污染物排放瞬间增加 10% - 30%。相反，若采用先进的智能动力切换控制系统，能实现快速、平稳切换，减少动力切换对主机燃烧状态的干扰，可将排放增加幅度控制在 5% 以内，保障船舶在动力切换过程中仍能维持较好的减排效果。在从电力驱动切换回主发动机动力时，同样存在类似情况，良好的切换控制能有效降低排放波动，维持减排水平。
