港口可根据船舶的排放等级制定差异化靠泊费用。对于符合国际先进排放标准，如达到 IMO Tier III 排放标准的船舶，给予靠泊费用 20% - 30% 的优惠。对于达到国内较严格排放标准（如地方制定的严于国家平均水平的标准）的船舶，靠泊费用优惠 10% - 20%。对于老旧、排放超标的船舶，适当提高靠泊费用，提高幅度在 10% - 30% 之间。同时，对于使用岸电的船舶，在靠泊期间，每使用一定电量，可减免部分靠泊费用，例如每使用 1000 度岸电，减免 1000 - 2000 元靠泊费。另外，若船舶采用清洁能源（如 LNG）作为动力，靠泊费用可额外给予 5% - 10% 的优惠。
