明治维新后，神户港进行了一系列现代化改造。首先，在港口设施建设方面，大规模扩建码头，采用西方先进的建筑技术和材料，建造了钢筋混凝土结构的码头，延长了码头岸线，以适应日益增长的船舶停靠需求。同时，加深拓宽航道，引进先进的疏浚设备，保障大型船只能够安全进出港口。其次，在设备更新上，引入了蒸汽起重机、电动装卸机械等现代化装卸设备，极大地提高了货物装卸效率。在港口管理方面，学习西方的管理模式，建立了现代化的港口管理机构，制定了详细的港口运营规章制度，规范船舶进出港流程和货物装卸、仓储管理等环节。此外，神户港周边配套设施也得到完善，建设了新的铁路、公路连接港口与内陆地区，加强了货物的转运能力，这些现代化改造使神户港迅速发展成为日本重要的现代化港口，在日本的对外贸易和经济发展中发挥了重要作用 。
