出口企业申请中国 - 澳大利亚自贸协定原产地证书通常需要准备以下文件和资料：
商业发票副本：详细列出货物的名称、规格、数量、价值等信息，是证明货物交易价格和交易情况的重要文件123。
装箱单副本：明确货物的包装情况、包装数量、毛重、净重等，便于海关对货物进行查验和核对23。
提单副本：显示货物的运输路线、起运港、目的港、运输工具等运输信息，证明货物的运输情况13。
出口合同或订单复印件：证明出口企业与澳大利亚进口商之间的贸易关系和交易内容5。
产品特定原产地规则相关证明材料：对于某些特定产品，可能需要提供符合特定原产地规则的证明材料，如特定的加工工序证明、原材料来源证明等。
代理授权委托书：如果企业委托代理机构办理原产地证书，需要提供代理授权委托书，明确代理权限和范围。
