企业报关单填写错误，海关会根据不同情况进行相应处理，具体如下：

企业主动申请修改或撤销

• 符合条件可申请修改：根据《中华人民共和国海关进出口货物报关单修改和撤销管理办法》，如果企业发现报关单填写错误，在一定条件下可向海关申请修改，如出口货物放行后，因装运、配载等原因造成原申报货物部分或全部退关、变更运输工具的；进出口货物在装载、运输、存储过程中发生溢短装，或者因不可抗力造成灭失、短损等，导致原申报数据与实际货物不符的等七种情形15.

• 提交证明材料：企业需通过中国国际贸易 “单一窗口” 等平台发起报关单修撤申请，并提交相应证明材料，如退关、变更运输工具证明材料，商检机构或者相关部门出具的证明材料等，海关会对申请及材料进行审核，符合规定的将及时完成修改15.

海关审核时发现错误

• 影响通关的错误：若海关在审核报关单时发现错误，且这些错误影响到货物的正常通关，如商品归类错误、申报数量与实际不符等，海关会要求企业对报关单进行修改或补充申报，企业需按照海关要求提供准确的信息和证明材料，以便海关重新审核 。

• 不影响通关的小错误：对于一些不影响货物通关和监管的小错误，如报关单上的个别文字错误等，海关可能会在审核时直接进行批注或更正，但如果这些小错误累计较多或可能引发其他问题，海关也会要求企业进行相应修改。

涉及违规行为的错误

• 行政处罚：如果企业报关单填写错误是由于故意瞒报、伪报等违规行为导致的，海关将根据《中华人民共和国海关法》和《中华人民共和国海关行政处罚实施条例》等相关法律法规，对企业进行行政处罚，处罚措施包括罚款、没收违法所得等，情节严重的，还可能追究企业的刑事责任14.

• 信用等级调整：此类违规行为还可能影响企业的海关信用等级，导致企业的信用评级降低，影响其在海关的通关便利程度和监管待遇15.

已完成通关手续后发现错误

• 补税等措施：如果在货物已经完成通关手续后，海关发现报关单存在错误，且该错误导致少征或漏征税款的，海关会要求企业补缴相应税款；如果因错误导致多征了税款，企业可按规定申请退税 。

• 后续监管要求：海关还会根据错误的性质和影响，对企业进行后续监管，如要求企业加强内部管理、完善报关流程等，以防止类似错误再次发生 。